Los peces Molly son generalmente resistentes, pero como todos los peces de acuario, pueden enfermar cuando las condiciones del agua o los cuidados disminuyen. La siguiente tabla cubre las enfermedades más comunes, sus síntomas y tratamientos. Mantener una alta calidad del agua es la mejor medida preventiva individual para casi todas ellas.
| Enfermedad | Síntomas | Tratamiento |
| Punto blanco (Ich) | Puntos blancos en el cuerpo, aletas plegadas, rascado contra superficies, letargo y pérdida de apetito | Aumentar la temperatura del agua, tratamiento con sal, baños medicados, medicamento contra el Ich, cuarentena del pez infectado |
| Podredumbre de aletas y cola | Aletas deshilachadas o perforadas, cambio de color, degeneración progresiva | Tratamientos antibacterianos o antifúngicos, mejorar las condiciones del agua, suplementos vitamínicos, cuarentena del pez infectado |
| Trastorno de la vejiga natatoria | Dificultad para nadar, comportamiento anormal, menor actividad | Cambio de dieta, reducir la profundidad del agua, medicación, ayuno |
| Oodinium (enfermedad del terciopelo) | Capa aterciopelada, comportamiento de rascado, aletas plegadas y letargo | Medicamento antiparasitario, aumento de temperatura, oscurecer el entorno, cuarentena del pez infectado |
| Columnaris | Parches similares al algodón, respiración alterada y actividad disminuida, reducción en la ingesta de comida | Uso de medicación antibacteriana, mejorar la calidad del agua, aumentar la temperatura, tratamiento con sal |
| Dactilogiros (gusanos de las branquias) | Movimiento rápido de las branquias, comportamiento de rascado, branquias rojas o inflamadas | Medicamento antiparasitario, baño de sal, aumentar la temperatura del agua, cuarentena del pez infectado |
| Hidropesía | Hinchazón o inflamación, escamas como una piña, letargo y pérdida de apetito | Medicación antibacteriana, baños de sal de Epsom, mejorar la calidad del agua, aislar al pez infectado |
| Enfermedad de los puntos negros | Aparición de puntos negros, comportamiento de rascado, apetito reducido y letargo | Medicamento antiparasitario, cuarentena del pez infectado, limpieza del tanque y cambio de agua |
| Estreñimiento | Hinchazón, poca o nula materia fecal, dificultad para nadar | Cambio de dieta, ayuno, baño de sal de Epsom |
| Escoliosis (columna torcida) | Columna doblada o curva, dificultad para nadar, debilidad general | Mejora de la dieta, tratamiento antibiótico, no existe cura garantizada |
| Tuberculosis en peces | Pérdida de peso y letargo, pérdida de escamas y color de piel, lesiones y úlceras | Antibióticos, aislar al pez infectado, eutanasia en casos graves |
| Ojos saltones (Exoftalmia) | Ojos protuberantes, ojos nublados, dificultad para nadar o letargo | Cambio de agua, tratamiento antibiótico, aislar al pez infectado |
| Gusano interno Camallanus | Gusanos visibles, pérdida de peso y apetito disminuido, letargo | Medicamento antiparasitario, cambios de agua y limpieza del tanque, cuarentena del pez infectado |
| Septicemia hemorrágica viral (VHS) | Hemorragias, actividad y apetito disminuidos, ojos protuberantes o vientre hinchado | No hay cura establecida, aislar a los molly infectados, medidas de soporte |
| Branquias inflamadas | Agrandamiento o enrojecimiento de las branquias, movimiento acelerado de las mismas, apetito disminuido o falta de energía | Cambio de agua y evaluación de su calidad, aplicación de antibióticos o tratamiento antiparasitario, segregación del pez infectado |
Una nota sobre la prevención
La mayoría de las enfermedades anteriores son provocadas o empeoradas por una mala calidad del agua y el estrés. Los cambios constantes de agua, una temperatura estable (22–28°C) y un entorno con bajo nivel de estrés ayudan mucho. Muchos aficionados también añaden una pequeña cantidad de sal para acuarios a los tanques de Molly, ya que estos toleran —y a menudo prosperan en— condiciones ligeramente salobres que inhiben a muchos patógenos comunes.
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